アクセス解析を見るとmt.cgiがやけに「/mt/mt-static/user_styles.css」にアクセスしていて、404エラー（Document Not Found ページが見つかりません）になっていました。実害はありませんが、あまり気持ちのいいものではないので解消しておきたいと思います。
このエラーはMT3.3系になってから出るエラーのようで、
Six Apartへ問い合わせをした結果、
「mt-staticディレクトリにuser_styles.css(空のファイル)を作成して下さい」
という主旨の回答がきました。
from.user_styles.cssとは何もの？ (ti-web.net blog)
とのことなので、/mt/mt-static/user_styles.cssという空ファイルを設置したところ、404エラーの発生はなくなりました。